海贼王中路飞与伙伴“分开”有几个关键节点，需要区分一下：

1. 香波地群岛分散（草帽一伙被熊拍飞）：动画第405集（漫画第513话），这是草帽一伙第一次真正意义上的全员分散，路飞被拍飞到女儿岛。

   

2. 顶上战争后路飞独自修炼：第516集左右，路飞在女儿岛决定不立刻集合，而是通过雷利安排让伙伴们先修炼两年。

3. 两年后重新集合：动画第517集开始（返回香波地群岛），第521集左右全员集结完毕。

所以如果你问的是“草帽一伙开始分开”的剧情，最标志性的是第405集（香波地群岛被巴索罗缪·熊拍散），之后他们直到第517集之后才重新汇合，中间路飞单独经历了女儿岛、推进城、顶上战争等剧情。